La primera prueba de fuego para Flores fue la SuperCopa Argentina 2014 en la provincia de San Luis, donde Vélez venció a Arsenal por 1-0 con gol de Héctor Canteros. Un título para sumar una nueva estrella, por ende 1 PJ - 1 PG.
Comenzaba la doble competencia. Se venía la Copa Libertadores '14 y el Torneo Final del mismo año. En la competencia internacional, enfrentó a Universitario (PER), The Strongest (BOL) y Atlético Paranaense (BRA). En la zona de grupos sacaría 15 puntos sobre los 18 en juego, siendo el mejor de los primeros. Sin embargo, perdería en Octavos de Final con el peor clasificado, Nacional (PAR). En conclusión fueron 8 PJ: 5 PG - 1 PE- 2 PP.
En el Torneo Final 2014, el Fortín tendría la mejor delantera del fútbol argentino: Mauro Zárate y Lucas Pratto. Si bien se lograron muchos goles, también le convirtieron bastante al Fortín. En aquella competencia Vélez saldría 6to con 9 PG - 3 PE - 7 PP.
El 24 de julio, El Fortín se enfrentaba a Estudiantes de Buenos Aires en los 16avos de Final. El conjunto de Caseros sorprendió a Vélez y lo derrotó de buena forma por 2 - 0. Nuevamente eliminado en primeras instancias en esa competición. 1 PJ - 1 PP.
Finalmente, el último torneo de Flores como DT denotó un rendimiento irregular, casi sin triunfos de visitante y perdiendo las dos últimas fechas en condición de local (trágica derrota vs Godoy Cruz y caída ante San Lorenzo). Fueron 7 PG - 4 PE - 8 PP, culminando en la posición 11º.
En conclusión, fueron 48 partidos jugados en los que se consiguieron 22 victorias, 8 empates y 18 derrotas. Además, Vélez convirtió 67 goles a favor y recibió 56, dejando una diferencia positiva de 11 tantos. Así fue el desempeño del equipo de Flores a lo largo de su ciclo y que determinó la salida del ídolo velezano como director técnico.
